Podlahové vytápění je naopak z hlediska higienického jedno z 
nejlepších, neboť proudění vzduchu v místnosti je minimální, 
pokud je správně navrženo dochází k ideálnímu teplotnímu 
rozvrstvení v místnosti. Jako povrchů podlah je dobré používat 
hladké (pevné bez chlupu) materiály, což rovněž výrazně snižuje 
celkovou prašnost (jednoduchá údržba vlhkým stíráním).
Dřevěné vlysy nejsou pro použití podlahového vytápění to 
nejvhodnější, dnes existuje široký výběr "laminopodlahů", které 
jsou od skutečného dřeva téměř k nerozeznání a jejichž použití 
pro podlahové vytápění je bezproblémové.