Při rekonstrukcí topení jste zcela změnil hydraulické poměry v 
otopné soustavě.Změnou dimense potrubí a novými radiátory jste 
zvýšil hydraulický odpor, což se muselo projevit snížením 
průtoku v této části a tím i nedostatečným vytápěním.Dalším 
důvodem,jak sám uvádíte, je umístění termostatu ovládající 
kotel.V současné době máte jedinou šanci,jak zlepšit vytápění ve 
studenějším bytě.U starých radiátorů musite přivřít radiátorové 
kohouty (pokud s něma vůbec jde pohnout)tak,abyste zvýšil odpor 
a snížil průtok, což se projeví vyšším průtokem v druhém 
bytě.Některé radiátorové kohouty (ventily) jsou dvouregulační. 
Nastavení průtoku lze provést pootočením clonky v kohoutu,druhá 
regulace je klasická (kolečkem).K zlepšení současné situace by 
možná přispělo zrušit ovládání kotle pokojovým termostatem a 
kotel ovládat jen kotlovým termostatem (nastavením teploty 
otopné vody).
Doporučuji osadit ventily u nových radiátorů termostatickou 
hlavicí tak, aby bylo možné nastavit požadovanou teplotu v 
jednotlivých místnostech.Protože pro dobrou funkci vytápění je 
důležitá hydraulika systému,doporučuji zpracovat na rekonstrukci 
vytápění dokumentaci projektantem.